२००३ मध्ये संग्रहालय न्यासाची स्थापना झाल्यापासून, संग्रहालयाने आपल्या स्थायी संग्रहाचा विस्तार नवीन कलाकृतींद्वारे करण्यास सुरूवात केली; ज्यात समकालीन कलेसोबतच एकोणिसाव्या शतकानंतर शहराच्या कला व सांस्कृतिक इतिहासाचे व्यापक प्रतिनिधित्व करणाऱ्या कलाकृती समाविष्ट होतात.

विसाव्या शतकाच्या प्रारंभीच्या काळातील सर ज.जी. कलामहाविद्यालयातील कलाकारांच्या चित्रांचा संग्रह हा विद्यालयाच्या घडणीचा काळ आणि भारतीय आधुनिकतेच्या प्रारंभाबद्दल मौलिक अंतर्दृष्टी देतो. तसंच तो संग्रहालयाच्या पूर्व आधुनिक स्थायी संग्रहाला पूरक ठरतो. ह्या कलाकृती त्या काळातील पुनरुज्जीवनवादी, 'भारतीय प्रबोधन' कला चळवळीचे चित्रण करतात, ज्यात त्या अभिजात भारतीय कलापद्धती, विशेषकरून प्राचीन राजपूत पारंपरिक चित्रशैली पासून प्रेरणा घेतात. केशव फडके, कमलाकांत सावे आणि सुभद्रा आनंदकर ह्यांची चित्रं ह्या संग्रहाचा भाग आहेत.

परंपरांशी समरसता' नावाच्या कलाप्रबंधित प्रदर्शनांच्या मालिकेअंतर्गत कलाकारांना संग्रहालयातील संचय, इतिहास आणि पुराभिलेखांशी संवाद साधण्यास आमंत्रित केले जाते. ह्या प्रदर्शनांतून संग्रहालयाने समकालीन कलाकार अतुल दोडिया, रीना कल्लाट, रंजनी शेट्टार, नलिनी मलानी आणि अर्चना हंडे ह्यांच्या कलाकृती संपादित केल्या आहेत.